SMA Kharisma Nurul Amal menjalankan tiga kelompok program untuk membentuk siswa yang unggul secara akademik dan berkarakter islami.
Kokurikuler
Kegiatan yang memperkuat pembelajaran di kelas, seperti proyek penguatan profil pelajar, kunjungan belajar, dan kajian keislaman.
Ekstrakurikuler
Pencak Silat, English Club, Pramuka, Volly Ball, Futsal, Sepak Bola, PMR, Bulu Tangkis, Rebana, Hadroh, Tilawah, dan Tahfidz Al-Quran.
Pengembangan Diri
Pembinaan minat, bakat, kepemimpinan, dan bimbingan konseling untuk menyiapkan siswa melanjutkan studi.
